104303 VU Molekularbiologie Grundübung
Wintersemester 2020/2021 | Stand: 19.11.2020 | LV auf Merkliste setzenDominik Regele, MSc PhD Dominik Regele, MSc PhD, +43 512 507 51454
Marc Sathianathan Marc Sathianathan
Melanie Zott, BSc MSc Melanie Zott, BSc MSc, +43 512 507 51448
Die Studierenden erwerben Kenntnisse über:
- Wissenschaftliche Datenbanken & Bioinformatische Auswertung von DNA/mRNA Information
- Primerdesign & in silico Klonierung
- Extraktion & Reinigung von DNA/RNA
- Synthese von cDNA
- Polymerase-Kettenreaktion (PCR)
- Klonierung von PCR-Fragmenten
- Transformation von DNA in E. coli
- Verifizierung der klonierten DNA Konstrukte („Blue-White-Screening“, colony PCR, Restriktionsanalyse, Agarose-Gelelektrophorese)
- Erstellung von Plasmid-Karten
- Klonierung von DNA-Konstrukten zur Expression von Fusions-Proteinen
Zusätzlich werden einige Grundlagen der Bioinformatik behandelt:
- Nutzung bioinformatischer Datenbanken (NCBI, Pubmed, Ensembl, ZFIN)
- Alignments/Suche von Sequenzen (lalign, blast)
- in silico Klonierungen (pDraw, Benchling)
- Primerdesign
- Nukleinsäuren
- Zellaufschluss
- DNA/RNA Extraktion, Fällung und Reinigung
- Gelelektrophorese
- Restriktionsenzyme
- Polymerase-Kettenreaktion (PCR)
- Klonierung (Restriktionsverdau, Ligation, Transformation)
- Bioinformatische Datenbanken & in silico Klonierung
- Kursplan:
- 1. Woche: Klonierung von zwei Genen aus dem Zebrafisch (gDNA/cDNA), ganzer Kurs gemeinsam
- 2. Woche: individuelle Klonierungs-Projekte in Kleingruppen
- RNA/DNA Extraktion und Aufreinigung
- cDNA Synthese mittels reverser Transkription
- in silico PCR/Klonierung
- PCR basierte Amplifikationen von cDNA/gDNA Abschnitten
- TA-Klonierung
- Verifizierung der Klonierung über „blue-white-screening“, colony PCR und Restriktionsanalyse
- Eingangsklausur nach der Vorlesung, deren positive Beurteilung die Voraussetzung zur Teilnahme an den praktischen Übungen ist!
- Kombinierte Leistungsbeurteilung durch aktive Teilnahme an der Übung sowie Abschlussprotokoll.
- Alberts et al., „Lehrbuch der Molekularen Zellbiologie“ (4. Auflage), 936 Seiten, ISBN-13:978-3527328246
- Lottspeich & Engels, „Bioanalytik“ (3. Auflage), 1208 Seiten, ISBN-13:978-3827429421
- T.A. Brown, „Genomes 3“ (3. Auflage), 750 Seiten, ISBN-13: 978-0815341383
Positiv beurteilte Pflichtmodule 2, 4, 14 und 15
Vorbesprechung am 1. Oktober 2019 um 10h in HS G
Bitte ausschließlich in Gruppe 0 (= Vorlesung) anmelden.
Eine (vorläufige) Kurseinteilung erfolgt entsprechend der Wünsche im Rahmen der Vorbesprechung. Nach Auswertung der Eingangsprüfung erfolgt die Kurszuteilung gemäß den Präferenzen und gereiht entsprechend des geltenden Curriculums (§ 4):
1. Anwesenheit bei der Vorbesprechung (persönlich oder durch Stellvertreterin oder Stellvertreter).
2. Datum der Erfüllung der Anmeldungsvoraussetzung/en, wobei jene Studierenden vorgezogen werden, die die Anmeldungsvoraussetzung/en früher erfüllt haben.
3. Anzahl der Semester, die die Studierenden für das Bachelorstudium Biologie gemeldet sind, wobei jene Studierenden vorgezogen werden, die länger gemeldet sind.
4. Losentscheid.