LFU:online

Die Studierenden lernen ausgewählte bioinformatische und statistische Methoden zur Untersuchung von Mikrobiomen kennen.

Basierend auf Testdatensätzen werden gängige bioinformatische Analyseprotokolle/Programme vergleichend angewandt. Die Ergebnisse werden visualisiert und mittels geeigneter statistischer Methoden eingehend analysiert. Abschließend erfolgt eine Interpretation aus ökologischer Sicht. Die erlernten Fähigkeiten werden anhand eines individuellen Datensatzes vertieft.

Praktische Übung am Computer:

I. Bioinformatische Datenanalyse: Illumina MiSeq Sequenzierdaten (prokaryotische 16S Markersequenzen) werden mittels CoMA, Mothur und QIIME2 analysiert.

II. Datenvisualisierung mittels Python.

III. Statistische Datenanalyse mittels R.

IV. Analyse und Interpretation eines individuellen Datensatzes und abschließende Präsentation der Ergebnisse.

Die Gesamtnote errechnet sich aus:

1. Einem Protokoll über die Auswertung der Testdatensätze (40%)

2. Teilnahme an einer simulierten Konferenz (individuelle Datensätze)

    a) Ausarbeitung eines Abstracts (20%)

    b) Präsentation von Forschungsergebnissen (40%)

Material zu den Übungen wird rechtzeitig in OLAT bereitgestellt.

Zu dieser Übung gehört das Seminar "Techniques in Microbial Ecology (LV-718766)", in dem wichtige methodische Aspekte diskutiert werden. Ausnahmsweise findet das Seminar zu dieser Übung im kommenden Sommersemester (SS2021) statt.

Online-Registrierung und Anwesenheit bei der Übungsvorbesprechung sind verpflichtend um die Teilnahme zu bestätigen!

Vorbesprechungstermin: 05.10.20, 17:30 Uhr im HS B

ACHTUNG: Aufgrund der aktuellen Situation wird der Kurs in diesem Jahr vollständig als Onlinelehrveranstaltung durchgeführt. Die einzelnen Termine werden in Absprache mit den Studenten festgesetzt. Die ursprünglich aufgelisteten Kurstermine (27.10.2020 - 10.11.2020) sind damit irrelevant!

https://www.uibk.ac.at/microbiology/study-affairs/